大豆再生相关基因GmLEC的克隆及生物信息学分析

作者：武小霞; 王敏; 陈庆山; 张超; 李思楠; 马彦龙; 孙晶; 刘明; 姜成涛; 李文滨; 李沫; 刘佳慧; 王智; 张希瑞; 苏安玉

来源：东北农业大学学报, 2015, (4): 1-9.

DOI：10.3969/j.issn.1005-9369.2015.04.001

• 大豆
• 再生
• GmLEC
• 生物信息学

利用同源克隆技术，对拟南芥再生相关基因LEC进行同源序列比对，从大豆中克隆LEC基因两个成员的全长CDS序列，得到大豆再生相关基因GmLEC1-a，GmLEC1-b及GmLEC2-a，GmLEC2-b，用生物信息学方法对大豆GmLEC1及GmLEC2基因核苷酸序列以及蛋白质结构、亲水性和疏水性及进化树等进行分析。结果表明，大豆再生相关基因GmLEC1-a编码区长度为672 bp，编码223个氨基酸，GmLEC1-b编码区长度为681 bp，编码226个氨基酸，GmLEC2-a编码区长度为2205 bp，编码734个氨基酸，GmLEC2-b编码区长度为2196 bp，编码731个氨基酸，GmLEC蛋白为亲水性不稳定蛋白；通过对LEC蛋白功能结构域进行分析发现，GmLEC1为H4超家族成员，GmLEC2为B3超家族成员，并均与拟南芥属植物亲缘较近。

• 出版日期2015
• 单位东北农业大学