摘要
粪产碱杆菌属对芳香族类物质表现出广泛的降解能力,本研究对1株粪产碱杆菌(Alcaligenes faecalis)JF101开展苯酚降解基因解析,并进一步挖掘其潜在功能。通过对菌株JF101全基因组测序、组装和功能注释,分析其降解苯酚的功能基因,并与5株近缘菌株开展比较基因组学研究。结果表明,JF101基因组大小为4 143 816 bp,GC含量为57.44%,含有3 804个编码蛋白基因和55个tRNA、9个r RNA、5个sRNA,在COG、GO、KEGG数据库中分别注释到3 040、2 529、2 415个基因。鉴定了11个苯酚降解基因。比较基因组学表明,菌株JF101没有质粒,与同属的5株菌株有2 008个共有同源基因家族和5个特异基因家族。此外发现菌株JF101含有与相容性溶质转运相关的Trk、Kdp等基因,实验测定了其耐盐能力。通过对菌株JF101全基因组的解析,为进一步阐释其苯酚降解机制及发展实际工程应用奠定了基础。
- 出版日期2023
- 单位化学化工学院; 广西大学