纽荷尔脐橙贮藏枯水相关ESTs分离与初步分析

作者:许兰珍; 刘小丰; 何永睿; 姚利晓; 彭爱红; 雷天刚; 陈善春
来源:园艺学报, 2011, 38(06): 1153-1160.
DOI:10.16420/j.issn.0513-353x.2011.06.020

摘要

为分析柑橘果实贮藏过程中枯水相关特异基因的表达情况,以纽荷尔脐橙(Citrus Sinensis Osbeck)采摘后贮藏至略见枯水果实的果肉为测验方(Tester),以刚采摘果实的果肉为驱动方(Driver),采用抑制性差减杂交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)技术成功构建了贮藏果实差减cDNA文库,共获得656个阳性克隆。随机挑取克隆进行菌液PCR分析,插入片段长度主要集中在100~1000bp。成功对213个克隆进行测序,获得有效序列143条,经序列分析,共得到53条uniESTs序列。在NCBI基因库中对这53个uniESTs进行BLAST分析,比对结果参照MIPS的分类标准,按功能分为14类,其中参与代谢、能量及蛋白合成的ESTs最多,分别占到了全部ESTs的17%、11%和13%。

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