中蜂囊状幼虫病毒LN-QY株VP_2结构蛋白的基因分析及B细胞抗原表位预测

作者：张琳; 钱爱东; 毛靖宇

来源：辽宁医学院学报, 2012, (05): 407-410+436+483-484.

• 中蜂囊状幼虫病毒
• VP2结构蛋白
• 空间结构
• B细胞表位
• 预测 Chinese Sacbrood Virus(CSBV)
• VP2 structural protein
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目的预测中蜂囊状幼虫病毒(Chinese sacbrood virus,CSBV)LN-QY株VP2蛋白的空间结构及其B细胞抗原表位。方法将已感染CSBV LN-QY株的RNA作为模板,进行RT-PCR扩增该毒株结构蛋白VP2基因,再与pMD18-T载体连接,之后转化大肠杆菌DH5α感受态,对经EcoRⅠ和BamH I双酶切鉴定为阳性的重组质粒进行测序,通过序列比对,获得LN-QY株VP2的核苷酸序列和推导的氨基酸序列,建立VP2结构蛋白的3D模型,在此基础上,应用DNAStar软件中的Protean模块综合分析结构蛋白的柔性区域、亲水性、表面可能性以及抗原指数等参数。结果 VP2结构蛋白的空间构象比较规则,其可能的B细胞抗原表位区域位于178-184,144-199,211-217氨基酸区段。结论本研究为CSBV LN-QY株VP2蛋白表位疫苗的设计以及血清诊断试剂盒的研制奠定了理论基础。

• 出版日期2012
• 单位吉林农业大学