大豆gma-miR1508a靶基因预测及功能分析

作者：李永光; 艾佳; 王涛; 金龙国; 邱丽娟; 李文滨

来源：大豆科学, 2014, 33(04): 479-482.

• 大豆
• miRNA
• 启动子
• 靶基因

microRNA(miRNA)是生物中广泛分布的、内源性的、由21~25个核苷酸大小的非编码单链小分子RNA。miRNA与靶基因mRNA具有互补关系,能够介导降解靶基因和转录后水平的基因沉默,引起目的基因表达的下调。通过利用PlantCARE、PMRD、BAR等数据库对gma-miR1508a启动子顺式调控元件和靶基因进行了生物信息学分析,启动子分析结果表明gma-miR1508a含有多种非生物胁迫响应元件,其表达受ABA、低温、干旱等胁迫诱导。利用PMRD软件预测获得7个gma-miR1508a的靶基因,分别参与了细胞凋亡、开花调控、逆境胁迫、细胞壁修饰等调控,最终通过拟南芥同源基因分析获得了Glyma10g03840.1、Glyma16g27800.1、Glyma17g07280.1等5个与低温反应相关的候选靶基因。

• 出版日期2014
• 单位东北农业大学; 农业部; 中国农业科学院作物科学研究所