Snail基因mRNA与结肠癌患者预后的生物信息学分析

作者：刘岩; 李双标; 许华; 张志坚; 李胜水^*; 张全乐; 张凤梅

来源：中国中西医结合外科杂志, 2020, 26(05): 800-808.

• 结直肠癌
• TCGA数据库
• Snail基因
• 信号通路
• 预后

目的:探讨Snail在结直肠癌中的表达及其与患者预后的关系。方法:应用生物信息分析工具比对TCGA数据库中Snail基因mRNA在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平;在STRING数据库中构建Snail蛋白-蛋白相互作用网络,并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集。同时,回顾性分析我院69例手术治疗的结直肠癌患者资料,根据Snail表达水平分为高、低表达组,比较两组患者总生存期(OS)和无疾病进展生存期(DFS)的差异。采用免疫组织化学法检测患者癌组织中Snail蛋白表达水平及其与患者临床病理特征的关系。结果:结直肠癌组织Snail基因mRNA表达水平明显高于癌旁组织;PDGFB基因与Snail呈正相关(r=0.624, P<0.05),SLC44A4基因与Snail呈负相关(r=–0.48, P<0.05)。Snail基因在生物学过程、细胞成分和分子功能方面分别富集于组蛋白H4脱乙酰化、ESC/E(Z)复合体和NAD依赖性组蛋白脱乙酰酶活性(H3-K14特异性)。KEGG信号通路富集于肿瘤相关信号通路、Notch信号通路、Wnt信号通路和结直肠癌相关信号通路等。生存分析显示,Snail高表达患者的OS低于低表达患者(HR=1.6, P<0.05),而Snail高、低表达患者的DFS差异无统计学意义(P>0.05)。Snail蛋白在结肠癌组织中的表达率为59.2%(41/69)。Snail蛋白高表达者在肿瘤分化程度、淋巴结转移、淋巴管侵犯率、Dukes分期等方面均差于低表达者,差异有统计学意义。结论:Snail基因在结直肠癌患者癌组织中表达水平上调,并可作为结直肠癌预后不良的分子标志物。

• 出版日期2020
• 单位河北省沧州中西医结合医院