大豆疫霉多态性SSR标记开发及遗传多样性分析

作者：徐静静; 王晓鸣; 武小菲; 朱振东

来源：植物病理学报, 2009, (04): 337-346.

• 大豆疫霉
• 基因组
• SSR标记
• 遗传多样性 Phytophthora sojae
• genome
• SSR marker
• genetic diversity

用FastPCR软件在大豆疫霉全基因组中搜索到1 234个含2～4个重复基元精确SSRs。选择260个SSRs设计引物,经对大豆疫霉5个分离物的基因组DNA检测,有212对(81.5%)有效扩增出SSR特征条带,112对(52.8%)扩增多态性。用18对多态性SSR引物分析了来自美国、中国黑龙江省和福建省大豆疫霉分离物的遗传多样性,在73个分离物中共扩增出112个等位变异,变异范围为4～9,平均为6.22个,表明选择的引物对具有高的多态性。在3个大豆疫霉群体中,黑龙江省和福建省分离物的遗传距离最近,美国和福建省分离物的遗传距离最远。UPGMA聚类将73个分离物划分为6组,其中8个美国分离物(7...

• 出版日期2009
• 单位中国农业科学院作物科学研究所