杜仲法尼烯基焦磷酸合酶基因cDNA全长的克隆与序列分析

作者：杜次; 李菁; 彭清忠; 汤鹏; 田向荣

来源：生命科学研究, 2015, (02): 100-105.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2015.02.001

• 杜仲
• FPPs
• 基因克隆
• 序列分析
• 生物信息学 Eucommia ulmoides
• Farnesyl pyrophosphate(FPPs)
• gene cloning
• sequence analysis
• bioinformatics

采用RT-PCR法,从杜仲幼嫩叶片中分离法尼烯基焦磷酸基因c DNA全长序列,克隆并对该基因全长序列进行生物信息学分析。从杜仲嫩叶中共获得两个基因分别命名为Eu FPPs1和Eu FPPs2,测序结果表明两基因开放阅读框分别为1 047 bp和1 029 bp,推测分别可以编码348个和342个氨基酸残基,在线预测表明两个蛋白序列均存在两个聚丙烯合酶位点。系统进化分析结果表明,Eu FPPs1和Eu FPPs2分别聚集于不同的分支,它们之间的进化距离为0.352,但是在亲缘关系上均与楤木和人参最近,进化距离分别为0.281、0.287,0.175、0.184。

• 出版日期2015
• 单位吉首大学