内蒙古典型草原细菌群落结构的PCR-DGGE检测

作者：周小奇; 王艳芬; 蔡莹; 黄祥忠; 郝彦宾; 田建卿; 柴团耀

来源：生态学报, 2007, (05): 1684-1689.

• 16S rDNA
• PCR-DGGE
• 液氮冻融法
• 蛋白珠法
• 内蒙古典型草原 16S rDNA
• PCR-DGGE
• Frozen-Thawing method
• Bead-Beating method
• Inner Mongolia steppe

用液氮冻融法和蛋白珠法对内蒙古典型草原土壤基因组DNA进行提取,用PCR-DGGE对细菌群落结构进行分析,并对主要的条带进行测序。发现蛋白珠法比液氮冻融法更能反应出实际的微生物群落结构和组成。内蒙古典型草原土壤细菌主要有5个分支:放线菌门(Actinobacteria),变形菌门(Proteobacteria)的α、β及γ类群,拟杆纲门(Bacteriodetes),芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)和酸杆菌门(Acidobacteria)。与基因库中进行比较后发现有4个序列和已知的细菌种类相似达到了99%以上。

• 出版日期2007
• 单位中国科学院大学; 中国科学院微生物研究所