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摘要
动物肠道菌群关系其健康状态，而菌群组成受到生活环境等因素的影响，探究其中关系有利于更好地进行物种保护。本研究基于非损伤性取样，利用16S rDNA高通量测序技术，开展不同地理纬度笼养国家二级重点保护野生动物狼（Canis lupus）的肠道菌群结构比较和初步功能预测。针对取自天津市动物园（38°88′N）和南京市红山森林动物园（31°14′N）两地饲养的狼粪便样本（分别简称为天津样本和南京样本）进行高通量测序，利用生物信息学比较分析两组样本的微生物组成和多样性差异。结果表明：Student’s t和Welch’s t检验显示南京样本的α多样性显著高于天津样本。在门水平上，厚壁菌门（Firmicutes）和放线菌门（Actinobacteria）是两组样本中的优势菌门，天津样本中弯曲杆菌门（Campilobacterota）的丰度显著高于南京样本。在属水平上，两组样本的肠道菌群中优势菌属均包括艰难梭菌属（Peptoclostridium）、柯林斯菌属（Collinsella）和狭义梭菌属（Clostridium＿sensu＿stricto＿1）。基于Unweighted UniFrac距离进行PCoA分析，发现天津样本和南京样本的菌群结构存在明显差异。最后，通过PICRUSt分析预测可能的代谢通路，并与两地狼的肠道菌群进行相关性分析。期望本研究结果为该物种饲养种群的异地保护和野生种群的综合管理提供科学参考。
- 出版日期2023
- 单位生命科学学院; 天津师范大学
