貂熊线粒体tRNA基因序列及其二级结构预测

作者：张士芳; 魏丹; 郭媛; 朱世兵; 李海军

来源：国土与自然资源研究, 2018, (02): 90-92.

DOI：10.16202/j.cnki.tnrs.2018.02.024

• 貂熊
• 线粒体t RNA
• 二级结构

貂熊属环北型动物,列入国家Ⅰ级重点保护动物。本文利用PCR扩增、测序和拼接获得了貂熊线粒体基因组全序列,其基因组全长16575bp,包括13种蛋白质,22种t RNA和2种r RNA和1个控制区。通过软件t RNAScan-SE1-21和RNA structure5.6对22种t RNA的二级结构进行预测,结果显示22种t RNA除t RNA-lys外均能折叠成典型的三叶草结构,碱基错配情况在氨基酸臂和DHU臂出现较多,而TψC臂和反密码子臂错配较少,共出现的35处错配,而其中25处为GU错配。碱基配对大部分符合Wasten-Click互补配对原则,少部分符合G-U摆动配对原则。

• 出版日期2018
• 单位黑龙江省科学院自然与生态研究所