侵染香蕉的黄瓜花叶病毒遗传多样性分析

作者：饶雪琴; 吴自林; 王婉; 周翎; 孙洁; 李华平^*

来源：植物保护学报, 2023, 50(03): 791-799.

DOI：10.13802/j.cnki.zwbhxb.2023.2021162

• 香蕉
• 黄瓜花叶病毒
• 遗传多样性
• 群体遗传
• 基因重组

为明确侵染香蕉的黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)的遗传多样性，对2012—2020年采集自广东、广西、云南和海南4省区的98份疑似感染CMV香蕉样品进行反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)检测，从确定感染香蕉样品中获得CMV分离物并对其外壳蛋白(coat protein,CP)编码基因进行克隆和序列分析，结合Gen Bank已报道的CMV CP基因序列进行种群结构及遗传多样性分析。结果表明，98份疑似样品中有39份感染了CMV，侵染香蕉的CMV分离物CP基因核苷酸序列相似率为82.9%～100.0%，大多数高于90.0%。系统进化分析结果表明，39个CMV香蕉分离物分为3个不同进化支，即进化支IA-a、IB-a和IB-b，都属于亚组Ⅰ，未发现归入亚组Ⅱ的CMV香蕉分离物。CMV不同进化支内的遗传距离为0.005～0.069，亚组Ⅱ与亚组Ⅰ之间的遗传距离大于亚组I内的遗传距离。遗传分析结果表明，CMV各种群的单倍型多样性Hd值均大于0.521，大部分种群的核苷酸多样性Pi值大于0.005；遗传差异统计量KST和Snn以及遗传分化系数FST分别为0.356、0.290和0.561;CMV种群间的基因流Nm为0.200。大多数种群的Tajima’s D、Fu&Li’s D和Fu&Li’s F值为负值，且多数未达显著水平。侵染香蕉的CMV CP基因有氨基酸取代，但未发生明显重组。表明侵染香蕉的CMV具有丰富的遗传多样性，且亚组间的遗传多样性大于亚组内的遗传多样性。

• 出版日期2023
• 单位广东省科学院; 华南农业大学