基于网络药理学探究肉桂治疗骨性关节炎的作用机制

作者:樊燕鑫; 权力; 沈计荣*
来源:延边大学医学学报, 2023, 46(02): 95-102.
DOI:10.16068/j.1000-1824.2023.02.003

摘要

[目的]采用网络药理学方法筛选肉桂治疗骨性关节炎(OA)的作用靶点并明确作用机制.[方法]通过检索中药系统药理学成分分析平台获得肉桂的活性化合物并在PubChem数据库中获取所得化合物的SMILES结构,将其导入至SwissTargetPrediction平台中预测活性成分的潜在靶点,再通过GeneCards数据库获得相关化合物靶点,取两者交集得到肉桂作用靶点;检索TTD、Drug Bank、OMIM、GAD、Pharm GKB、DisGe NET数据库获得OA疾病相关靶点,并取与肉桂作用靶点的交集;采用STRING数据库及Cytoscape 3.2.1软件构建靶点相互作用网络图,并利用cytoHubba插件的MCC算法筛选关键靶点;基于DAVID数据库对靶点进行GO富集和KEGG通路富集分析.[结果]共得到肉桂活性化合物18个,肉桂-OA交集靶点40个,经MCC算法筛选得到关键基因10个,即PTGS2、MAPK8、MMP9、ALB、MMP2、MMP1、SERPINE1、TGFB1、PLAU和ESR1.GO富集共33个结果,其中生物过程主要包括胶原蛋白分解代谢过程、炎症反应、DNA转录正调控、氧化应激反应及组织缺氧反应等;分子功能主要包括血红素结合、芳香化酶活性、金属内肽酶活性及过氧化物酶活性等;细胞组成主要包括细胞外间隙、细胞外基质、血液微粒及核被膜内腔等.KEGG富集相关通路共32条,包括破骨细胞分化、花生四烯酸代谢、低氧诱导因子-1、核转录因子-κB、Toll样受体及肿瘤坏死因子等信号通路.[结论]采用网络药理学方法初步预测了肉桂治疗OA的抗炎、影响细胞增殖、分化及凋亡、抗氧化等潜在的作用机制,为肉桂的活性成分研究和实验研究提供了理论依据.

全文