秦岭地区核桃自然群体和栽培群体的遗传多样性及其演化关系——基于nrDNA ITS序列分析

作者：胡昳恒; 党萌; 张甜; 罗桂春; 夏海龙; 周惠娟; 呼东峰; 贺亮; 马振华; 赵鹏

来源：林业科学, 2014, 50(12): 47-55.

• 核桃
• 秦岭
• 群体遗传结构
• ITS序列
• 基因流

基于19个自然群体和10个栽培群体共359个个体的核糖体内转录间隔区(nr DNA ITS)序列分析,研究秦岭地区核桃的群体遗传多样性、群体遗传结构及单倍型地理分布。359条ITS序列上共有18个单倍型,表现出较低的遗传多样性(Hd=0.274,π=0.005 5),群体间单倍型遗传多样性差异较大(Hd=00.679,π=00.017)。Network单倍型网络分析表明,单倍型14和单倍型7比较原始,且栽培群体与自然群体之间对古老单倍型H14与H7有着明显的共享现象,基因流较强(Nm=48.62)。综合中性检验及失配分析的结果,可推断在近期历史上秦岭地区核桃没有发生过群体扩张事件。AMOVA分析结果显示,秦岭地区自然核桃群体遗传变异主要存在于群体内(53.4%),群体间遗传分化水平较低(GST=0.067)。单倍型最大简约树和邻接树均可将18个单倍型及所有核桃群体分成两大支。

• 出版日期2014
• 单位陕西省环境监测中心站; 国家林业局西北林业调查规划设计院; 西安市环境监测站; 西北大学