摘要

目的对SNP原始文本格式转换成规范JSON格式,便于计算机软件分析人类的基因。方法利用Node.js流函数pipe对庞大的SNP原始文本文件进行分段读取进内存并转换成规范的JSON格式,最后分段地写入到一个最终结果文件中去。结果针对不同基因测序厂商提供的检测结果,提供了一种相对规范的JSON格式,开发出了转换工具包。结论采用JSON文件格式可以较好、较简单地对多厂商的SNP原始文本文件进行规范的表达,使用Node.js开发的转换工具效率较高。