大鳞副泥鳅mtDNA Cytb基因序列分析及分子系统发育研究

作者：胡建华; 祖国掌; 荣朝振; 孙守旗; 孙棠丽

来源：水产科学, 2011, (09): 551-554.

DOI：10.16378/j.cnki.1003-1111.2011.09.007

• 大鳞副泥鳅
• 细胞色素b基因
• 系统发育 Paramisgurnus dabryanus Sauvage
• cytochrome b gene
• phylogeny

对15尾大鳞副泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,获得长度为1140 bp的细胞色素b基因同源片断。所有序列中共检测到15种单倍型,序列中共出现81个变异位点,总变异率为7.1%。各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失,转换/颠换比为6.36。变异位点在3位密码子中的分布呈现偏倚,密码子第3位的变异占总变异的85.18%,而第1和第2位均只占7.41%。A、T、C、G碱基的平均含量分别为27.4%、30.8%、26.5%、15.3%,A+T>C+G。在所得序列中,密码子第1位上4种碱基使用较为均衡;第2位上碱基T的使用率高达41%,碱基G的使用率低至13.2%;第3位上碱...

• 出版日期2011
• 单位安徽农业大学