铁皮石斛尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子偏好性分析

作者：孙晶; 何涛; 万闰兰; 彭小凤; 淳泽

来源：应用与环境生物学报, 2014, (05): 759-766.

• 铁皮石斛
• 尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)
• 密码子偏好性
• 聚类分析 Dendrobium officinale
• UDP-glucose pyrophosphorylase gene
• codon bias
• cluster analysis

尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(UDP-Glucose pyrophosphorylase,UGPase)是糖代谢的主要酶类之一.为了解铁皮石斛(Dendrobium officinale)尿苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶基因(UGP)的密码子使用特性,运用CHIPS、CUSP和CodonW在线程序分析自主克隆的铁皮石斛UGP基因(GenBank登录号:KF711982.1)的密码子偏好性,并与其他物种的UGP基因以及基因组进行比较.结果显示,铁皮石斛UGP基因偏好使用A/T结尾的密码子,27种偏好密码子(RSCU>1)中偏好性较强的有TAA和CCU(RSCU≥2).与其他物种的UGP基因密码子使用对比...

• 出版日期2014
• 单位中国科学院成都生物研究所; 中国科学院大学