基于高通量测序的椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性分析

作者：王睿怡; 周小倩; 吴毅强; 杨欣宴; 王若航; 马杰; 周姝雅; 凡哲玮; 杨宇哲; 陈玉娟^*; 孙恩涛^*

来源：皖南医学院学报, 2023, 42(04): 394-400.

• 椭圆食粉螨
• 微生物
• 多样性
• 高通量测序

目的:阐明椭圆食粉螨体内微生物群落结构及多样性。方法:实验室饲养椭圆食粉螨，利用Illumina MiSeq技术对其体内细菌16S rRNA基因的V4区和真菌ITS1序列进行测序，统计体内微生物的操作分类单元(OTUs)数量，分析其体内微生物群落结构及Alpha多样性。结果:获得椭圆食粉螨体内细菌16s rRNA和真菌ITS1有效序列209 643和145 646条，根据序列相似性>97%进行聚类分析，分别得到了248和146个OTUs。基于OTUs进行物种注释，共注释到细菌类群20门，32纲，110目，177科，128属；共注释到真菌类群3门，15纲，36目，65科，92属。其中，在门分类水平，本实验室饲养椭圆食粉螨体内细菌群落主要注释到厚壁菌门Firmicutes(43.52%)、拟杆菌门Bacteroidota(31.94%)、放线菌门Actinobacteriota(20.04%)、变形菌门Proteobacteria(4.40%);真菌类群以子囊菌门Ascomycota(98.60%)为绝对优势菌门。在属分类水平，细菌类群主要注释到葡萄球菌属Staphylococcus(43.27%)、土壤杆形菌属Solitalea(31.81%)、棒杆菌属Corynebacterium(7.61%)、考克氏菌属Kocuria(7.06%)、短杆菌属Brevibacterium(4.11%)、鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas(2.45%);真菌优势属为Trichomonascus(71.52%)、曲霉属Aspergillus(10.38%)、链格孢属Alternaria(9.29%)。Alpha多样性指数表明椭圆食粉螨体内微生物群落结构具有较高的丰富度和多样性。结论:椭圆食粉螨体内细菌和真菌群落具有较高的多样性和丰富度，且个体间微生物多样性存在差异。

• 出版日期2023
• 单位基础医学院; 公共卫生学院; 皖南医学院