科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的 构建昆明市HIV-1感染者的分子传播网络并分析其网络特征，识别主要传播亚型、传播方式和重点高危人群，为本市艾滋病防控采取重点干预措施提供依据。方法 选择2019—2020年云南省传染病医院接受治疗的昆明市HIV-1感染者作为研究对象，并收集整理其的流行病学资料，采用RT-nested-PCR扩增HIV-1pol区基因，contig Express 6.0对序列进行剪切、拼接和校对，Bio Edit 7.0比对剪切序列，HIV-1 BLAST在线工具亚型分型和MEGAX进行亚型验证，使用Hy Phy软件计算pol区基因序列之间的成对基因距离，Graph Pad-Prism8.0确定最佳阈值，导入Cytoscope3.7.2进行HIV-1分子网络可视化展示并进行网络特征分析。结果 成功扩增获得505条pol区基因序列，确定最佳阈值为0.013后，共有232条序列进入网络，入网率为45.94%。不同亚型、不同病毒载量、不同地区和不同耐药情况的入网构成比存在显著性差异。网络成簇总连接度为552，总的节点中位连接度M(P25,P75)=2.0(1,4)，单节点最高连接度为30，不同组别中成簇比例最高的分别是CRF08＿BC亚型、异性传播人群、31～59岁年段和昆明中部地区。结论 昆明市HIV-1感染者基因亚型分布主要以CRF08＿BC、CRF07＿BC亚型流行为主，昆明市HIV-1传播风险较高的人群为经异性传播的中老年人感染者，应加强对该网络中大分子簇的监测，同时需对昆明市近几年的HIV-1pol区基因序列进行分析以建立HIV-1动态分子网络，对活跃的高危人群采取精准地防控。
- 出版日期2023
- 单位公共卫生学院; 云南省传染病专科医院; 昆明医科大学
