大豆TST基因的生物信息学及表达模式分析

作者：李文滨; 张永艳; 王金阳; 徐玲秀; 宋伟; 赵雪; 韩英鹏

来源：东北农业大学学报, 2018, 49(01): 1-9.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2018.01.001

• 大豆
• GmTST
• 生物信息学分析
• 表达分析

TST为典型膜结合蛋白,具有高度保守序列,广泛存在于植物组织和细胞中。文章根据NCBI网站、Phytozomes数据库和MEGA软件分析大豆基因组中TST同源基因生物信息,发现大豆相关数据库中有8个大豆TST相关基因拷贝,其中5个TST基因与拟南芥和甜菜亲缘关系较近;通过实时荧光定量PCR分析大豆TST基因时空表达模式,确定GmTST2.1基因发挥拷贝作用;克隆GmTST2.1基因并分析其生物信息发现,GmTST2.1蛋白质由734个氨基酸组成,PI为5.1不稳定疏水性蛋白质,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲和片层结构组成,有典型N端跨膜结构域-中间胞质区-C端跨膜区结构域特征。研究分析GmTST基因生物信息学和表达模式,为进一步验证GmTST基因生物学功能提供借鉴和理论基础。

• 出版日期2018
• 单位大豆研究所; 东北农业大学