大豆病程相关蛋白PR-5及其同源蛋白TPLs的生物信息学分析

作者：魏崃; 张丽; 王伟威; 于志远; 喻德跃; 刘丽君

来源：大豆科学, 2016, (03): 380-387.

• 大豆病程相关蛋白
• 类甜蛋白
• 系统进化分析
• 生物信息学分析 Soybean pathogenesis-related proteins
• TLPs
• Evaluation analysis
• Bioinformatics

大豆病程相关蛋白PR-5又称为类甜蛋白TLPs,广泛分布于高等植物体内,各种生物和非生物胁迫诱导(病原微生物、渗透胁迫,机械损伤和植物激素等)均可诱导其表达。本研究以PR-5编码基因Glyma01g42670.1为目的基因,对该基因及其同源蛋白的结构和功能进行了分析;通过生物信息学的方法,共筛选获得42条大豆TLPs蛋白质序列,并用Mega 4.1软件构建其系统进化树;同时对Soy Base中的大豆TLPs相关的表达数据进行分析。结果表明:大豆病程相关蛋白PR-5的编码基因Glyma01g42670.1编码240个氨基酸的多肽链,p I 6.26,是一种酸性蛋白,属于疏水蛋白,该蛋白质具有典型...

• 出版日期2016-5-25
• 单位南京农业大学