七叶一枝花根际与非根际土壤细菌群落多样性

作者：郑梅霞; 陈宏; 朱育菁^*; 苏海兰^*

来源：福建农业学报, 2020, 35(12): 1357-1367.

DOI：10.19303/j.issn.1008-0384.2020.12.009

• 七叶一枝花
• 根际
• 土壤
• 多样性

【目的】研究七叶一枝花野生环境和人工栽培中根际与非根际土壤细菌群落结构的差异,为揭示野生七叶一枝花和移栽七叶一枝花土壤的细菌群落结构,明确不同栽培模式下土壤细菌群落的变化,探究野生七叶一枝花土壤细菌的多样性的优势。【方法】本研究提取七叶一枝花土壤宏基因组DNA,采用illumina miseq 2×300 bp进行高通量测序;对两种栽培模式土壤的细菌多样性进行分析;在不同水平上分析两种栽培模式下的显著性差异,并通过LDA EffectSize组间群落差异分析两种栽培模式中起关键作用的门和属。【结果】研究结果表明七叶一枝花土壤中细菌多样性丰富,包括21个门、33个纲、52个目、89个科和160个属。七叶一枝花非根际土壤细菌多样性指数Chao、Ace、Shannon和Simpson指数显示非根际土壤细菌群落具有更高的丰富性和多样性。在门水平和科水平没有显著差异。在纲水平,具有显著差异的是绿菌纲Chlorobia,其在七叶一枝花根际土壤中的含量低于非根际土壤;在目水平,具有显著差异的是绿菌目Chlorobiales和粘球菌目Myxococcales,其在七叶一枝花根际土壤中的含量低于非根际土壤;在属水平,具有显著差异的是不动杆菌属Acinetobacter和Rudaea,其在七叶一枝花根际土壤中的含量低于非根际土壤;在种水平,具有显著差异的是Mucilaginibacter ximonensis、uncultured Nannocystineae bacterium、uncultured-Singulisphaera sp.、uncultured Solibacteraceae bacterium和uncultured Xanthomonadaceae bacterium,其在七叶一枝花根际土壤中的含量均低于非根际。【结论】本研究表明七叶一枝花非根际土壤细菌群落具有更高的丰富性和多样性,为进一步探索七叶一枝花的土壤微生物环境奠定基础。

• 出版日期2020
• 单位福建省农业科学院