H9N2亚型禽流感病毒河南分离株的全基因克隆及序列分析

作者：张静; 雷小亚; 李昕键; 张宇; 陈立根; 孙乾晋; 李如意; 白牧原; 蔺文成; 谢青梅

来源：黑龙江畜牧兽医, 2017, (11): 5-9.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2017.0951

• 禽流感病毒
• H9N2
• 基因组
• 核苷酸
• 氨基酸

为了研究H9N2亚型禽流感病毒的基因组变异情况,试验以一株2015年在河南省分离的H9N2亚型Ck/HN/12/15为研究对象,用RT-PCR方法扩增病毒基因组的8个基因片段并进行克隆和测序,将测序结果与Gen Bank公布的H9N2参考毒株序列进行比对分析,绘制各基因片段的进化树。结果表明:分离株的PB1、PA、NP、NS基因与1998年中国上海鸡源毒株Ck/SH/F/98(H9N2)归于同一进化分支,核苷酸序列同源性分别为93.57%、90.48%、87.66%和86.64%。分离株的HA、NA基因与1997年中国香港鸭源毒株Dk/HK/Y280/97(H9N2)属同一个进化分支,核苷酸序列同源性分别为87.62%和85.32%。该毒株裂解位点处的序列是PSRSSR,符合低致病性禽流感病毒的分子特点。该株HA基因的226位(对应H3亚型位置)氨基酸为Leu,更易与哺乳动物唾液酸受体结合。说明应该做好对此类H9N2亚型禽流感病毒免疫防控工作,避免在人和禽类之间传播。

• 出版日期2017
• 单位华南农业大学