丙氨酸三肽的稳定构象的探究

作者：杨忠志; 袁圆

来源：辽宁师范大学学报(自然科学版), 2013, (04): 497-501.

• 三肽
• 二面角
• 构象
• 势能面扫描
• 能量极小值 tripeptide
• dihedral angel
• conformation
• scan of PES
• minimum of the energy

探究快速地获得丙氨酸三肽的稳定构象.利用Gaussian09程序包中的HF/6-31G(d,p)方法得到丙氨酸三肽势能面.固定二面角φ2、ψ2的度数,改变二面角φ1、ψ1,计算了丙氨酸三肽不同结构的相对能量,这些结构的相对能量的图像趋势大致相同,可知两组二面角之间影响不大.使用丙氨酸二肽稳定构象所对应的骨架二面角的组合,获得丙氨酸三肽的初始构型,使用B3LYP/6-31G(d,p)方法优化获得其稳定构象.这种方法可为多肽分子寻找稳定构象提供1种简单而快速的方法.

• 出版日期2013
• 单位辽宁师范大学