胡桃EST-SSR标记的筛选及引物设计

作者：冯怡; 张智俊; 张舍龙; 罗淑萍

来源：安徽农业科学, 2011, (36): 22217-22219+22276.

DOI：10.13989/j.cnki.0517-6611.2011.36.253

• 胡桃
• EST-SSR
• 微卫星
• 引物 Walnut
• EST-SSR
• Microsatellite
• Primers

[目的]筛选胡桃的EST-SSR分子标记并对其进行引物设计。[方法]利用生物信息学方法对NCBI网上公开的5213条胡桃(Jug-lans regia Linn.)ESTs序列进行EST-SSR特征分析,利用Primer 3.0软件对筛选出的EST序列设计引物。[结果]在ESTs序列中共检索出207个SSR,其中无冗余序列188,检出率为3.97%,平均分布距离为21.12 kb,包括92种重复基元,其中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,分别占总数目的 31.40%和35.27%;对随机筛选出的50条SSR引物进行PCR扩增验证,初步筛选出30对引物。[结论]通过对胡桃EST序列中SSR位点的...

• 出版日期2011
• 单位浙江农林大学; 新疆农业大学