球等鞭金藻MYB基因家族成员全基因组鉴定和特性分析

作者：韩玉莹; 陈璐瑶; 陈由强; 陈多; 陈建楠^*

来源：福建农业科技, 2023, 54(04): 22-35.

DOI：10.13651/j.cnki.fjnykj.2023.04.004

• 球等鞭金藻
• MYB基因家族
• 全基因组
• 光质
• 表达分析

为了深入理解球等鞭金藻MYB基因家族在基因调控网络中的作用机制，使用MYB＿DNA-binding保守结构域在球等鞭金藻蛋白序列中筛选出60个MYB基因家族成员，并对这些基因家族成员的蛋白(一、二、三级)结构预测和分析、亚细胞结构定位、基因结构及保守结构域等方面进行了分析。结果表明：这些MYB基因家族成员可分为3个cluster,其中R2-MYB和R3-MYB主要集中在cluster 3中，R2R3-MYB则含有大部分家族成员，表明这些基因在球等鞭金藻中起着重要的生物学功能。不同分支的亲缘关系较远，同一分支的关系较近，这表明球等鞭金藻MYB基因家族在演化过程中形成了一些适应性的变化。通过基因组内共线性分析，研究发现球等鞭金藻全基因组内有177对片段复制基因和46对串联复制基因，其中MYB基因家族有2对复制基因，包括串联重复基因对IZ004267和IZ007345以及片段重复基因对IZ006462和IZ006102。结合染色体定位分析，IZ006462和IZ006102位于9号染色体，这也支持上述片段重复的判断。这些重复基因对的Ka/Ks值小于1,表明这些基因在扩张过程中受到了基因纯化选择，功能相当保守。

• 出版日期2023
• 单位生命科学学院; 福建师范大学