大豆基因组CLC同源基因家族的生物信息学分析

作者：李伟; 王龙超; 曹金花; 於丙军^*

来源：南京农业大学学报, 2014, 37(03): 35-43.

• 大豆
• CLC同源基因
• CBS结构域
• 氨基酸残基保守区
• 通道蛋白
• 转运蛋白 soybean
• CLC homologous genes
• CBS domain
• conserved amino acid residue region
• channel protein
• transport protein

利用NCBI网站、Phytozome数据库和有关生物信息学软件,对大豆基因组CLC(chloride channel)同源基因家族进行系统的预测分析和比较。结果表明:大豆CLC同源基因有8~9个拷贝,分别分布于第1、5、9、11、13、16和19号染色体上,内含子数目为4~23;编码的大豆CLC蛋白氨基酸数量为725~823,整体一致性为63.43%,相对分子质量为(80~91)×103,理论等电点为6.45~8.94,带正或负电荷氨基酸残基比例为7%~10%,均为跨膜蛋白(含9~12个跨膜区),除Glyma16g06190外均含有2个CBS结构域;具有(Ⅰ)GS/PGIPE、(Ⅱ)GKE/A...

• 出版日期2014
• 单位南京农业大学; 生命科学学院