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摘要
本发明公开了一种筛选与目的化合物合成相关的基因的方法与应用。本发明通过将三代转录本作为参考转录本,然后将二代测序数据比对到转录本获得各转录本丰度；再使用RSEM软件对二代组装出来的转录本进行定量,进行基因间的差异表达分析,获得萜类物质合成过程中的关键基因。相较于单独的使用二代转录组测序技术和三代全长转录组测序技术,本发明既能充分利用三代转录组无需拼接即可得到全长转录本序列从而准确性高的优点,又能充分考虑二代转录组测序数据对基因定量表达检测的优点,大大提高了基因组注释的准确性,筛选得到目的化合物合成途径中的相关基因。通过该方法,本发明首次得到4条与阴香单萜类物质合成酶相关的基因。
- 出版日期2021-5-24
- 单位华南理工大学
