木榄ERF转录因子基因的克隆及功能分析初探

作者：赵杨敏; 庞俊峰; 张占路; 姬澎; 尉亚辉; 吴燕民

来源：中国农业科技导报, 2012, (04): 66-72.

• 木榄
• RACE-PCR技术
• AP2/EREBPF蛋白
• ERF转录因子
• 生物信息学 Bruguiera gymnorhiza
• RACE-PCR technology
• AP2/EREBPF protein
• ERF transcription factor
• bioinformatics

利用RACE-PCR技术,以深圳红树自然保护区的木榄为材料,克隆出一个ERF类转录因子基因的cDNA全长序列,命名为BgERF(GenBank序列号:GU593720)。生物信息学分析表明:该基因全长1 870 bp,完整开放阅读框1 425 bp,具有一个保守的AP2/EREBP结构域,且编码的由475个氨基酸组成的蛋白具有典型的1个α螺旋,3个β转角的三维结构,在AP2/EREBP结构域的第14位为丙氨酸(A),第19位为天冬氨酸(D),属于AP2/EREBPF蛋白家族中的ERF类转录因子;NCBI-BLAST比对结果表明:该基因与胡萝卜、拟南芥、水稻、辣椒、番茄、大豆、马铃薯、陆地棉等植...

• 出版日期2012
• 单位中国农业科学院生物技术研究所