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摘要
为认识原核Mre B蛋白和真核actin蛋白结构相关性和进化关系,应用SWISS-MEDOL、PROCHECK和Py MOL等生物信息学软件分别对19种Mre B蛋白和16种actin蛋白进行了同源建模、质量评估、蛋白叠合比对分析;以Mre B和actin为分子指标利用MEGA6构建生物进化树分析其进化关系。研究结果表明同源建模获得的蛋白模型基本符合立体化学规则,有较高的合理性与可靠性,其中大部分属于高质量模型(落于最适区的氨基酸残基数>90%);蛋白叠合比对结果表明Mre B和actin蛋白虽为同源蛋白,氨基酸序列和结构上存在一定相似性,但一些区域仍存在明显差异。MEGA6构建的进化树基本能反映与传统分类系统一致的进化轨迹,但在某些细节方面显示出与传统分类系统相异的亲缘关系。
- 出版日期2015
- 单位文山学院
