Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上微卫星分布

作者：杨纪青; 杨硕; 杨莉; 袁磊; 杨建强

来源：中国农学通报, 2010, (24): 20-27.

• Tomato leaf curl Bangladesh病毒
• 完整基因组
• 微卫星
• 分布特性
• 最优完全子图算法 Tomato leaf curl Bangladesh virus
• complete genome
• microsatellite
• distribution characteristic
• optimal complete subgraph algorithm

为了展示Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组上的微卫星分布特性。借助MATLAB软件、应用最优完全子图算法,提取并展示NCBI数据库中Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上的微卫星分布特性,计算1-碱基组至6-碱基组在完整基因组序列上重复出现的次数和位置,展示它们的分布规律(指数函数)。结果表明:Tomato leaf curl Bangladesh病毒完整基因组(AF_188481.1)上各种N-碱基组(N取1至6)最大的重复出现次数,随N按指数函数数减少;笔者提取和展示Tomato leaf curl...

• 出版日期2010
• 单位湖北文理学院