侵染大豆的花生斑驳病毒公主岭分离物基因组测序及分析

作者:张春雨; 李小宇; 王晨; 战笑蕾; 刘建青; 王永志*
来源:植物保护, 2022, 48(01): 61-65.
DOI:10.16688/j.zwbh.2020544

摘要

本研究利用小RNA深度测序法在大豆叶片上检测到1株花生斑驳病毒Peanut mottle virus(PeMoV),根据小RNA深度测序结果和GenBank公布的PeMoV基因组序列设计引物克隆了PeMoV公主岭分离物(PeMoV-Gongzhuling)的基因组序列。测序结果经拼接后获得了PeMoV-Gongzhuling基因组,大小为9 709个核苷酸(GenBank登录号:MT790744)。该基因组在第123位—第9 422位存在1个大的开放阅读框(ORF),编码1个多聚蛋白(分子量351.28 kD)。PeMoV-Gongzhuling与GenBank中已登录的其他PeMoV分离物的基因组的核苷酸序列一致性为95.88%~99.53%,氨基酸序列一致性为97.39%~99.84%,其中与韩国分离物GYBU-92 (MT603819)在核苷酸和氨基酸水平上的一致性均为最高。

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