大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达

作者：郑炜君; 徐兆师; 冯志娟; 李连城; 陈明; 柴守诚; 马有志

来源：作物学报, 2012, (09): 1570-1582.

• NF-YB家族
• 全基因组鉴定
• 进化
• 差异表达
• 启动子 NF-YB
• Genome-wide identification
• Phylogeny
• Differential expression
• Promoter

利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析。利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析。结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类。启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件。各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达。研究结果促进了NF-YB家族基因...

• 出版日期2012
• 单位中国农业科学院作物科学研究所; 西北农林科技大学