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摘要
目的 采用网络药理学方法观察天然化合物色胺酮的抗肿瘤药理机制。方法 通过ADMETlab2.0数据库对色胺酮分子的类药性进行评估，运用PharmMapper、SwissTargetPrediction数据库预测色胺酮的作用靶点，借助OMIM数据库、DisGeNET数据库收集肿瘤疾病靶点，筛选出色胺酮抗肿瘤作用潜在蛋白靶点。利用STRING数据库、Cytoscape3.7软件依次构建蛋白靶点之间的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、“化合物-靶点-通路-疾病”网络；基于DAVID数据库进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。采用AutodockVina1.1.2进行分子对接，分析色胺酮与筛选出的核心靶点蛋白之间相互作用。借助现有临床肿瘤数据库，对核心靶点开展基因表达谱交互分析。结果 通过网络药理学研究共获得色胺酮抗肿瘤核心靶点158个，GO功能富集分析的生物过程与炎症反应、蛋白质磷酸化、细胞内信号转导等关联，细胞组成与胞浆、细胞质、高分子复合物等较为密切，分子功能与MAPK酶活性、ATP绑定、酶结合等相关。KEGG通路富集分析表明癌症的途径、PI3K-AKT信号通路等是色胺酮发挥抗肿瘤的主要途径，涉及核心靶点AKT1、PI3K、MAPK1、HSP90AA1、JAK2、NFKB1等。色胺酮与5种核心靶点AKT1、HSP90AA1、PI3K、JAK2、MAPK1之间有较好的结合活性，结合能均不超过-8.6kcal·mol-1。色胺酮抗肿瘤核心靶点的基因表达谱交互分析结果显示上述5种核心蛋白靶点均在人类肿瘤疾病发生发展中扮演重要作用。结论色胺酮通过PI3K-AKT等信号通路发挥抗肿瘤作用。
- 出版日期2023
- 单位基础医学院; 贵州医科大学
