应用机器学习方法构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签

作者:王强; 安杨; 张国森; 董寰; 郭向前*
来源:河南大学学报(医学版), 2019, 38(01): 26-29.
DOI:10.15991/j.cnki.41-1361/r.2019.01.006

摘要

[目的]应用机器学习方法,利用TCGA与GEO数据,构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签。[方法]收集TCGA和GSE45510数据,建立机器学习模型,利用pamr包预测标签,将预测亚型与实际值对比以评估预测效果。[结果]经测试,阈值取6.639时,分类准确率为87.8%,相关基因159个。[结论]利用机器学习方法构建平滑肌肉瘤分子分型预测标签,可以用于预测平滑肌肉瘤分子亚型,提高诊断精度,指导未来平滑肌肉瘤亚型特异性靶向治疗,推动精准治疗发展。

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