苋菜试管苗amaNACA 2-like基因克隆及生物信息学分析

作者：刘生财; 匡华琴; 谢礼洋; 赖钟雄

来源：东北农业大学学报, 2014, (01): 83-89.

DOI：10.19720/j.cnki.issn.1005-9369.2014.01.014

• 苋菜
• 试管苗
• amaNACAlike
• 克隆
• 生物信息学 Amaranthus tricolor
• in vitro plantlets
• amaNACA2-like
• cloning
• bioinformatics

以苋菜试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE技术进行amaNACA-2 like基因全长cDNA序列克隆,对其进行生物信息学分析。结果表明,苋菜amaNACA-2 like基因cDNA全长为896 bp,其中5'UTR 66 bp,3'UTR216 bp,poly A尾长17 bp,并包含一个615 bp开放阅读框,编码205个氨基酸。GenBank登录号为KC588966。生物信息学分析表明,该蛋白是一种亲水性细胞质蛋白,包括10个磷酸化位点和8个功能位点;该蛋白属于NAC蛋白超级家族(NAC superfamily),包含NAC功能位点,同时包括一段UBA超家族结构域;其二级结构由α螺...

• 出版日期2014
• 单位福建农林大学