敲低Stau1后小鼠前脂肪细胞系3T3-L1中FOXP1的表达增加

作者：孟轩羽; 刘迪晖; 蒋硕; 关亚群^*; 梁小弟^*

来源：基础医学与临床, 2023, 43(01): 130-136.

DOI：10.16352/j.issn.1001-6325.2023.01.0130

• Staufen1
• 叉头盒蛋白p1
• 转录组测序
• 脂肪细胞分化

目的 在小鼠前脂肪细胞系3T3-L1分化过程中敲低双链RNA结合蛋白Staufen1(Stau1)后筛选差异表达的基因，分析其生物学功能，并用qPCR验证测序结果。方法 用RNA-seq分析Stau1敲低后基因的转录调控。构建STAU1 shRNA并转染3T3-L1细胞，鸡尾酒方法诱导其分化为成熟脂肪细胞，收取0、4 d的细胞设立对照组和STAU1敲低组(各3组生物重复样本)收取12组样品的细胞基因芯片信息，以变化倍数log2(Fold change)>1且校正后的P<0.05作为条件筛选Stau1敲低的细胞与对照组样本间的差异表达基因，进行基因本体论(GO)及代谢通路分析(KEGG通路数据库),qPCR验证差异表达的基因。荧光素酶报告基因实验验证SATU1与叉头盒蛋白P1 FOXP1 mRNA 3′UTR上Staufen1结合位点(SBS)存在结合。结果 较对照组STAU1敲低细胞组中共筛选出差异表达基因588个，其中上调406个、下调182个。差异表达基因主要参与的生物学过程中脂代谢、炎性反应因子，主要富集的信号通路有糖代谢和能量代谢相关通路。敲低Stau1后FOXP1表达升高5.3倍，软件预测FOXP1 mRNA 3′UTR含有STAU1结合位点，荧光素酶报告基因验证了FOXP1 mRNA 3′UTR含有STAU1结合位点。结论 推测STAU1能够与FOXP1 mRNA上的STAU1结合位点结合并促进其降解。

• 出版日期2023
• 单位基础医学院; 新疆医科大学