川白芷NAC家族的生物信息及表达模式分析

作者：黄文娟; 许鑫; 陈靳松; 蒋翼杰; 姚菲; 江美彦; 张慧慧; 吴卫^*

来源：中国中药杂志, 2021, 46(07): 1769-1782.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20201225.101

• 白芷NAC家族
• 生物信息分析
• 非生物胁迫
• 激素
• 不同器官

NAC(NAM/ATAF/CUC)蛋白在植物生长发育、次生细胞壁形成及逆境响应等过程发挥着重要的作用。该研究基于白芷测序数据,利用生物信息学的方法系统分析其NAC家族,并对其进行表达模式分析。研究表明,白芷NAC家族挑选出75个候选转录因子,编码的蛋白大小为148～641,其结构域和Motif相对保守,均为不稳定亲水性蛋白,大部分NAC蛋白都定位于细胞核中;白芷和拟南芥NAC家族蛋白的系统进化分析显示,在17个亚家族中,二者的NAC成员在每个亚族中呈不均匀分布,表明物种进化朝多个方向发展,其中ANAC063亚家族不含有白芷NAC成员,可能是由于物种功能进化所致;蛋白跨膜结构及信号肽分析显示,NAC转录因子是能够进行跨膜运输的,但并未发现其信号肽功能;表达模式分析显示大部分白芷NAC家族转录因子对非生物胁迫和激素均有不同程度响应,且激素的作用较为明显,特别是ABA和IAA;在不同器官中,大部分白芷NAC家族成员在根韧皮部中表达量较高,其次是根木质部。该研究为进一步研究白芷NAC转录因子的功能及解决白芷生物学问题奠定了基础。

• 出版日期2021
• 单位四川农业大学