口腔鳞状细胞癌组织中环状RNA的差异表达谱分析

作者：赵思语; 欧阳少波; 王军; 黄自坤; 罗清; 廖岚

来源：口腔疾病防治, 2018, 26(02): 83-89.

DOI：10.12016/j.issn.2096-1456.2018.02.003

• 环状RNA
• 口腔
• 鳞状细胞
• 癌
• 癌旁组织
• 基因芯片
• RT-qPCR
• 靶基因

目的分析环状RNA(circular RNA,circRNA)在口腔鳞状细胞癌组织及癌旁组织中表达谱的差异及临床意义。方法利用高通量芯片技术检测3例口腔鳞状细胞癌患者癌组织和配对癌旁组织中的差异表达circRNA,采用实时定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)方法验证所筛选的部分circRNA分子在45对口腔鳞状细胞癌组织与癌旁组织中的表达情况。分析上调明显的circRNA表达水平与口腔鳞状细胞癌临床病理特征的关系,采用Arraystar公司circRNA靶基因分析软件,预测可能与上调明显的circRNA相互作用的靶miRNA分子。结果口腔鳞状细胞癌患者癌组织与癌旁组织样本间差异表达的circRNA共155个,其中上调45个,下调110个。所挑选的在口腔鳞状细胞癌组织上调或下调差异表达最显著的3条circRNA中RT-qPCR验证结果显示,与癌旁组织相比,口腔鳞癌癌组织中hsacirc0001874、hsacirc0001971、hascirc0067934表达上调,hsacirc0000520、hsacirc0023944、hsacirc0000140表达下调,与芯片检测结果一致。在上述芯片筛选的口腔鳞状细胞癌组织特征circRNA表达谱中,hsacirc0001874上调表达最明显,hsacirc0001874的表达在不同临床分期及细胞分化程度存在显著差异;circRNA靶基因分析软件预测结果提示,miR-103a-3p、miR-107、miR-593-5p、miR-661和miR-662可能是hsacirc0001874的潜在靶基因。结论多种circRNA在口腔鳞状细胞癌组织中呈异常表达,这些表达差异的circRNA及其潜在的靶基因可能与口腔鳞状细胞癌的发生、发展密切相关。

• 出版日期2018
• 单位江西省口腔生物医学重点实验室; 南昌大学第二附属医院; 南昌大学附属口腔医院; 南昌大学第一附属医院