大豆内生细菌种群多样性PCR-DGGE分析方法的优化研究

作者:孟利强; 赵晓宇; 张先成; 李晶; 张淑梅; 曹旭; 沙长青
来源:黑龙江大学自然科学学报, 2013, (03): 390-395.
DOI:10.13482/j.issn1001-7011.2013.03.010

摘要

建立了一种适合研究大豆内生细菌种群结构的PCR-DGGE分析方法,筛选适合分析大豆内生细菌的引物,采用巢氏PCR方法获得内生细菌16S rDNA的V6、V7、V8三个高变区,通过优化DGGE技术的变性梯度范围、电泳时间和上样量的大小来获得最佳的DGGE条带图谱。经过优化确定了适合大豆内生细菌研究的引物为968F-1378R,变性剂梯度为40%~60%,且在电压180 V时电泳时间6 h最为合适,上样量为15μL时可获得高分别率的DGGE条带。

  • 出版日期2013
  • 单位黑龙江省科学院微生物研究所

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