四川凉山地区烟草黑胫病菌的ITS序列分析

作者:张海珊; 许大凤; 刘东阳; 周本国; 高正良; 卢军; 章东方; 严丹侃; 王芳; 王勇
来源:中国烟草科学, 2015, (01): 96-101.
DOI:10.13496/j.issn.1007-5119.2015.01.018

摘要

本研究利用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR扩增四川省凉山州不同地区的20株烟草黑胫病菌的ITS序列,并对PCR产物进行了克隆测序。结果表明,20个供试菌株的ITS1-5.8S-ITS2总长均为803 bp;各菌株之间的ITS序列同源性达到99.3%以上;与Gen Bank报道的寄生疫霉台湾烟草分离株Phytophthora parasitica(GU111675.1)的同源性在99.6%~100%之间;但各菌株ITS序列的个别位点存在突变,这些突变主要集中在ITS2区上,其中第468处的突变具有一定地域性,主要为德昌和西昌的菌株。利用MEGA6软件对20个供试菌株及Gen B...

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