牛蛙(Rana catesbeiana)皮肤抗菌肽的cDNA克隆及序列分析

作者：赵瑞利; 韩俊友; 韩文瑜; 雷连成; 江丽娜; 张俊敏; 欧阳萍

来源：中国兽医学报, 2011, (10): 1433-1437.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2011.10.018

• 牛蛙
• 抗菌肽
• cDNA克隆
• 序列分析 Rana catesbeiana
• antibacterial peptide
• cDNA cloning
• sequence analysis

为了解牛蛙皮肤抗菌肽的多样性及结构特点,根据GenBank数据库中蛙属抗菌肽基因信号肽序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增牛蛙皮肤抗菌肽基因,克隆得到cDNA全长序列并进行测序和序列分析。用生物信息学软件分析其cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质。结果得到48个完整的cDNA序列,分别编码24种抗菌肽前体,它们均由信号肽、前导肽和成熟肽3部分组成。对序列测定结果的预测分析表明,牛蛙皮肤抗菌肽前体核苷酸序列与已报道的其他蛙类抗菌肽具有较高的同源性,同源性达到80%以上,但成熟肽的序列变异很大,具有物种特异性,其中6个为新的抗菌肽序列。牛蛙皮肤抗菌肽成熟肽的二级结构主要以α-螺旋和β-折叠为...

• 出版日期2011
• 单位天津农学院; 吉林大学