水稻单核苷酸多态性及其应用

作者：刘传光; 张桂权

来源：遗传, 2006, (06): 737-744.

• 单核苷酸多态性
• 水稻
• 基因分型
• 遗传育种 single nucleotide polymorphism(SNP)
• rice
• genotyping
• genetics and breeding

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)在水稻中数量多,分布密度高,最高SNPs数量可达80 127个,每154个碱基就存在一个SNP,平均SNP频率为0.65%左右。SNPs水稻亚种内品种间也很丰富,亲缘关系近的品种(或品系)间,即使用其他传统的分子标记方法难以找到多态性位点,用SNPs标记法也能找到数量可观的多态性位点。水稻SNP频率在各染色体间存在显著差异,而且在每条染色体上的分布也不均匀,存在明显的SNPs富集区域和稀缺区域。水稻SNPs的发现方法主要有对样本DNA的PCR产物直接测序、从SSR区段检测SNPs,以及从基因组序列和EST...

• 出版日期2006
• 单位华南农业大学; 广东省农业科学院