埃可病毒6型分离株KM57-09VP1基因的遗传特征

作者：陈俊英; 王湘宜; 潘玥; 叶君; 张名; 孙强明; 马绍辉

来源：中国生物制品学杂志, 2012, (05): 545-548.

DOI：10.13200/j.cjb.2012.05.26.chenjy.006

• 埃可病毒6型
• VP1基因
• 序列分析 ECHO virus 6
• VP1 gene
• Sequencing

目的分析2009年昆明市无菌性脑膜炎患儿脑脊液埃可病毒6型(ECHO virus 6,E6)KM57-09分离株VP1基因的遗传特征。方法采用RD、Hep-2细胞对无菌性脑膜炎患儿脑脊液样本进行病毒分离,应用RT-PCR法扩增VP1基因,并进行测序;采用NCBI BLAST软件对所测定的节段序列进行数据库比对;采用Omiga软件对所测定节段序列的核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行编辑、比对、拼接;采用Mega4.1软件分析,并与18个参考株的VP1基因序列进行比较。结果分离株为E6,其VP1区的核苷酸长度与其他E6均为867 bp;KM57-09株与其他E6分离株核苷酸同源性在77.6%～96....

• 出版日期2012
• 单位中国医学科学院北京协和医院