多穗柯转录组分析及黄酮类化合物合成相关基因的挖掘

作者:宋菊; 黄剑; 李志栋; 龙月红; 邢朝斌
来源:中国中药杂志, 2017, 42(04): 675-679.
DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20170103.024

摘要

多穗柯具有甜味和保健功效,其中黄酮类化物是主要活性物质。为获取多穗柯转录组数据库以及黄酮类化合物生物合成相关基因,该研究用RNA-Seq中的Illumina Hi Seq 4000对多穗柯嫩叶进行转录组测序,共获得6 Gb数据,拼接后得到41 043条Unigene,与7个基因数据库进行比对,可归类于51个GO分类中,涉及到237个KEGG标准代谢通路。找到黄酮合成相关基因28条。通过Micro Satallite(MISA)软件分析筛选到18 161个SSR,其中单碱基重复最丰富,有7 346个。此研究得到大量转录本信息,为多穗柯的分子生物学研究提供了宝贵的转录组数据库资源。

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