黑斑病菌诱导的紫薯抑制性差减杂交文库构建及ESTs分析

作者：曾绍华; 张聪; 李明; 屈会娟; 张敏; 阎文昭; 蒲志刚

来源：西南农业学报, 2014, (01): 53-58.

DOI：10.16213/j.cnki.scjas.2014.01.034

• 紫薯
• 黑斑病菌诱导
• 抑制差减杂交技术
• 表达序列标签 Purple sweet potato
• Black rot induction
• SSH
• ESTs

本研究以紫薯1号为材料,运用抑制性差减杂交(SSH)技术,构建了经黑斑病菌诱导12、24、36、48、60 h后的甘薯块根混合SSH cDNA文库。随机挑取103个cDNA克隆进行5'端测序,共获得87个非重复序列,其中包括29个重叠群,58个独立的ESTs,利用tblastx对87个序列在NCBI数据库中进行同源性比对。结果表明,在编号为14的EST中找到了"蔷薇"黑斑抗性muRdr1基因位点,基因全序列包括muRdr1A、muRdr1B、muRdr1C、muRdr1D、muRdr1E、muRdr1F、muRdr1G、muRdr1H、muRdr1I共9个基因。另外有2类基因的含量较高,一类是...

• 出版日期2014
• 单位四川省农业科学院生物技术核技术研究所; 四川农业大学