采用粗粒化的分子动力学模拟研究了Amyloid蛋白对树枝形分子(PAMAM)的影响,计算了在酸性和中性两种不同p H下,PAMAM分子与Amyloid蛋白不同距离下的回旋半径,形状因子以及径向分布函数.经分析发现Amyloid蛋白对PAMAM分子有较大影响,但树枝形分子内部空间不足以包裹Amyloid蛋白分子.自由能计算结果表明酸性p H条件下PAMAM分子无法吸附到Amyloid蛋白分子表面,而中性条件下二者却能形成稳定复合结构。
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