不同引物扩增对东海陆架沉积物真核微型生物多样性的影响

作者：俞凯成; 王健鑫; 陶诗; 刘明华; 蒋然; 刘雪珠; 黄备

来源：海洋与湖沼, 2014, (04): 806-816.

• 真核微型生物
• 多样性
• 引物
• 18S rDNA
• ITS microeukaryote
• diversity
• primer
• 18S rDNA
• ITS

采用三对通用引物(ITS1/ITS4,EF3/EF4,NS1/NS4)检测其对东海陆架DH-13站点表层沉积物真核微型生物的扩增特异性和多样性差异。对323个有效克隆子进行OTU分型和多样性分析,结果表明,NS1/NS4引物扩增所获得的文库多样性最高,EF3/EF4其次,ITS1/ITS4最后。通过NCBI比对和分类学研究,发现优势种群主要为原生生物界,包括丝足虫门(Cercozoa,占所有OTU的36.4%)、横裂甲藻纲(Dinophyceae,占14.2%)、不等鞭毛门(Stramenopiles,占7.4%)和纤毛虫门(Ciliophora,占6.3%);另含部分真菌界如子囊菌门(Asc...

• 出版日期2014-7-15
• 单位浙江海洋大学; 浙江省舟山海洋生态环境监测站