1例HCV不同基因型/亚型混合感染的确认

作者：许茹; 王敏; 廖峭; 黄珂; 熊华平; 黄杰庭; 陈秋宇; 戎霞; 付涌水

来源：现代医学, 2015, 43(08): 961-967.

• 丙型肝炎病毒
• 混合感染
• 克隆测序

目的:鉴定1例NS5B区和E1区PCR产物测序结果分型不一致的HCV病毒株为基因重组还是混合感染。方法:提取血浆的病毒总RNA,逆转录后进行巢式PCR扩增,以NS5B和E1编码区为目的基因进行PCR扩增并测序,通过构建进化树进行基因分型,发现两个编码区基因分型的结果不同,对NS5B和E1区进行克隆测序,每个编码区分别挑取50个克隆进行测序和基因分型;针对HCV全长序列分别设计7对型特异性引物并进行PCR扩增。结果:NS5B(8 2568 641 bp)区PCR产物测序后的分型结果为1b,E1(6971 322 bp)区为2a;NS5B(8 2669 274 bp)基因的50个克隆测序结果均为1b,C/E1(8492 152 bp)基因的50个克隆测序结果均为2a;7个片段的PCR型特异性扩增以及进化分析发现,在同一区域既存在1b亚型,也存在2a亚型。结论:该病例为1b和2a的混合感染。

• 出版日期2015
• 单位广州血液中心