喹啉酮类药物与细菌Ⅱ型拓扑异构酶的结合模式

作者：朱文友; 张东华^*; 张剑超; 刘中婷; 庄文昌; 高美华

来源：广东化工, 2021, 48(24): 1-26.

• 细菌Ⅱ型拓扑异构酶
• 分子对接
• 抑制剂
• AutoDock 4.2
• 结合能

细菌Ⅱ型拓扑异构酶是细菌DNA复制和细胞存活所必需的酶,可作为抗菌药的靶点。本文运用AutoDock4.2对接软件,将30种抑制剂对接到细菌II型拓扑异构酶的活性中心。结果显示,活性口袋中残基Asp73、Arg136与抑制剂分子形成氢键网络,将抑制剂分子固定在活性中心,使得抑制剂与酶结合更加稳定。其中抑制剂分子11、19、21、22、23号结合能最大,分别为-11.79、-10.93、-12.24、-11.71、-11.49kcal/mol,与细菌Ⅱ型拓扑异构酶结合得最稳定。计算结果为改进氟喹诺酮类药物对细菌Ⅱ型拓扑异构酶的抑制作用提供了重要的数据依据,为以后新抗菌素药物的开发提供帮助。

• 出版日期2021
• 单位徐州工程学院